生物工程专业始建于1993年，2010年首批入选教育部“卓越工程师教育培养计划”、天津市品牌专业；2019年首批入选国家一流本科专业建设点、通过工程教育认证。生物工程专业所依托的生物化工学科为国家“211工程”、“985工程”重点建设学科。建设有国家级规划教材3部，国家级一流课程3门，建立了完善的本、硕、博和博士后一体化的人才培养体系。

本专业师资力量雄厚，拥有国家级高层次人才3人次，国家级青年人才5人次，教育部新（跨）世纪优秀人才培养计划入选者5人。曾获得国家级教学成果二等奖1项、天津市教学成果一等奖2项。

依托生物化工国家重点学科、合成生物学前沿科学中心和系统生物工程教育部重点实验室、天津市生物与制药工程重点实验室，形成了五个特色鲜明的研究方向：生物信息学与合成生物学、界面与分子生物工程、生物反应与代谢工程、工业生物过程的系统分析与优化、生物医用材料与技术。生物工程专业在全国高校专业排名中名列前茅，拥有本科、硕士、博士、博士后流动站的完整人才培养体系。